Совет университета
Совет университета является главным органом самоуправления, который создан с целью решения основных вопросов деятельности университета. Непосредственное руководство деятельностью совета университета осуществляет председатель совета, ректор университета С.П. Рубникович. Решения совета являются обязательными для всех сотрудников университета, обучающихся и их законных представителей.
Научно-методический совет
Научно-методический совет является органом самоуправления, обеспечивающим разработку и реализацию мероприятий, направленных на повышение качества образовательного процесса и его научно-методического обеспечения.
Координационный совет по идеологической и воспитательной работе
Координационный Cовет по идеологической и воспитательной работе создан с целью определения концептуальных подходов к организации и проведению воспитательной работы и выработки рекомендаций по вопросам идеологического сопровождения образовательного процесса.
Совет профилактики
Совет профилактики – коллективный орган, создаваемый из числа представителей трудового коллектива и руководителей структурных подразделений для предупреждения правонарушений, антиалкогольной пропаганды и проведения воспитательно-профилактической работы с нарушителями правопорядка.
Диссертационные советы
При Белорусском государственном медицинском университете создано и функционирует 8 советов по защите докторских и кандидатских диссертаций по 16 специальностям.